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Oportunidade para Bioinformata no Projeto "REDES REGULATÓRIAS E SINALIZAÇÃO ASSOCIADAS À CANA ENERGIA"


Bolsa de Treinamento Técnico 5 FAPESP


Desenvolvimento de ferramentas de bioinformática para a plataforma SUCEST-FUN


Contato: Glaucia Souza – Instituto de Química – USP

http://www.bv.fapesp.br/pt/pesquisador/926/glaucia-mendes-souza/
http://lattes.cnpq.br/9035886932770957

Av. Prof. Lineu Prestes 748 – sala 954

Enviar Currículo e Histórico Escolar da Graduação e Pós-Graduação (versão completa, incluindo todas as disciplinas cursadas independentemente da situação de aproveitamento escolar) para This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it. até 10/02/2019.

A Bolsa TT-5 se destina a graduado(a), especialista em TI com pelo menos cinco anos de experiência após a graduação ou título de doutorado, sem vínculo empregatício (valor mensal em dedicação integral: R$ 7.372,40).

O laboratório de Transdução de Sinal do Instituto de Química da USP contribui para a Biologia de Sistemas da cana-de-açúcar e para isso analisa e disponibiliza resultados obtidos no sequenciamento do genoma, análise do transcriptoma e metaboloma dessa gramínea. Uma das ferramentas desenvolvidas pelo laboratório é uma aplicação web (http://sucest-fun.org/wsapp) para acesso e análise dos dados do banco SUCEST-FUN DB. Essa ferramenta tem o font-end desenvolvido em linguagem Java e diversos scripts desenvolvidos nas linguagens Perl e R que fazem análise dos dados e inserção dos resultados no banco de dados, utilizando a linguagem SQL. Além da utilização da ferramenta e disponibilização para uso público e de colaboradores de dados que incluem resultados de análise de oligoarranjos, RNA-Seq, alinhamento de genomas, é previsto o desenvolvimento de novas ferramentas para execução de tarefas específicas, de acordo com os dados obtidos ao longo do projeto. Assim, é esperado do bolsista um conhecimento de bioinformata sênior, de preferência, com pós-graduação na área de Bioinformática, Biologia Molecular Computacional ou Ciência da Computação com ênfase em algoritmos biológicos.